La sintaxis de INSERT IGNORE que conocemos de MySQL es distinta en SQLite; pues en lugar de usar:

INSERT IGNORE

Se utiliza:

INSERT OR IGNORE

Insert ignore en SQLite

Aquí un ejemplo de insert ignore en SQLite:

insert or ignore into materias_grupos(id_grupo, id_materia)
values (37, 1);

Recuerda que ambas columnas deben ser marcadas como únicas (con unique), te muestro un ejemplo de la definición de una tabla con columnas únicas:

create table if not exists materias_grupos(
    id integer primary key autoincrement,
    id_grupo integer not null unique,
    id_materia integer not null unique,
    foreign key(id_grupo) references grupos(id),
    foreign key(id_materia) references materias(id)
);

Si quieres leer más sobre Insert ignore mira por favor este post.